Die Pflanzen der Alpen sind berühmt für ihre Farbenpracht und Formenvielfalt. An die 4500 Gefäßpflanzen sind in ca. 900 Pflanzengesellschaften (= charakteristische, oft regelhafte Kombinationen verschiedener Pflanzenarten, an bestimmten Standorten, z.B. Schneetälchen, alpine Rasen oder Buchenwälder) in den Alpen heimisch.

Das Klima der Alpen ist sehr vielfältig und kleinräumig äußerst unterschiedlich: die Voralpen sind oft regenreich, es gibt  inneralpine Trockengebiete oder Kältewüsten  rund um die Berggipfel. Diese Bedingungen verursachen besondere Anpassungen und Überlebensstrategien der alpinen Pflanzen, besonders oberhalb der Waldgrenze. Hier ist die Vegetationszeit kurz, oft nur 2 - 3 Monate, der Wind mitunter kräftig und die Temperaturunterschiede zwischen Tag und Nacht oder innerhalb weniger Stunden beträchtlich. Zwergwuchs, Langlebigkeit und große Temperaturtoleranz zeichnen deshalb viele hochalpine Pflanzen aus.

Der Alpenzoo zeigt ausgewählte Pflanzenarten kennzeichnend für Standorte und Höhenstufen – von den Flußauen bis in die Felsregion. Die typischen Pflanzengesellschaften sind entlang der Wege gepflanzt, und die meisten Gehege sind mit der lebensraumtypischen Vegetation ausgestattet.